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前置需求

  • Docker 與 Docker Compose
  • (選用)一台可達的 Ollama 伺服器,用於語意 / 混合搜尋(OLLAMA_BASE_URL)。未設定時,搜尋自動退回關鍵字模式。
  • 部分資料來源需自行取得授權檔案(SNOMED CT、LOINC、ICD-10 zip 等),詳見資料來源

啟動服務

cp .env.example .env                # 設定 POSTGRES_PASSWORD 等必要變數
docker compose up -d

docker compose up -d 會啟動:postgrespgbouncerredisminiominio-init(建立 bucket)、app(MCP 伺服器 + 管理後台)以及 admin-worker(背景工作執行器)。

啟用管理後台

資料匯入由管理後台觸發、交由 admin-worker 背景執行(已無獨立的 CLI data-loader 容器),因此請先在 .env 啟用管理後台:

ADMIN_ENABLED=true
ADMIN_USERNAME=admin
# python -c "import hashlib; print('sha256$' + hashlib.sha256(b'change-me').hexdigest())"
ADMIN_PASSWORD_HASH=sha256$...
ADMIN_SESSION_SECRET=change_this_admin_session_secret

重新啟動後(docker compose up -d),於 http://<host>:8000/admin 登入。詳見管理後台

載入資料(管理後台 → Modules)

在 Modules 頁籤依模組匯入:

類型 模組 操作
需上傳來源檔 ICD-10-CM/PCS、LOINC、SNOMED CT、FHIR IG(package.tgz 於 Sources / Modules 上傳來源檔後按匯入
API 自動抓取 藥品(TFDA)、健康補充品、食品營養 直接按匯入,或設定排程
內建種子資料 臨床指引 直接執行
  • 藥物域為三階段管線(索引 → 爬取豐富 → OCR/LLM 分析),其中爬取與分析需設定 TFDA / OCR / 分析 LLM 端點(見 .envDRUG_*,或於 Settings 頁籤管理)。
  • 嵌入(語意搜尋)會在各模組匯入後自動回填,也可於模組頁面單獨重建。
  • 匯入進度、步驟時間軸與即時日誌見 Tasks 頁籤;背景機制見背景工作與排程

開發時若要直接執行單一 loader 階段,loader/main.py 的各階段仍存在(由 worker 呼叫),可在 worker 容器內以模組方式執行。

連線客戶端

伺服器在同一個埠(預設 8000)同時提供兩種介面:

1. MCP(原生)

預設以 streamable-http 模式在 http://<host>:8000/mcp 提供服務(見 .envMCP_TRANSPORT / MCP_PORT / MCP_PATH)。供原生 MCP 客戶端使用(Claude Desktop、Open WebUI v0.6.31+ 的 MCP 連線等)。若要供 Claude Desktop 以 stdio 模式使用,設定 MCP_TRANSPORT=stdio

2. OpenAPI bridge(給只支援 OpenAPI 的客戶端)

對於不支援原生 MCP、只能接 OpenAPI 工具伺服器的客戶端(例如 Open WebUI 的 External Tools / OpenAPI 類型),伺服器內建一層 OpenAPI 介面,不需額外的 mcpo 代理或容器:

  • GET http://<host>:8000/openapi.json — 依目前已啟用的工具動態產生 OpenAPI 3.1 規格
  • POST http://<host>:8000/tools/<工具名> — 以 JSON body 當參數呼叫工具

在客戶端只要填基底網址 http://<host>:8000,它會自動抓 /openapi.json 並列出全部工具。

例:Open WebUI → Settings → Tools → 以 OpenAPI 類型新增,URL 填 http://<host>:8000

注意:/mcp 與 OpenAPI bridge 目前皆未強制驗證;對外開放時請在前面加反向代理或 token。

驗證

pip install pytest pytest-asyncio
python -m pytest tests/ -v

或先用 health_check 工具確認伺服器與各模組狀態。